Khepera III a été conçu pour qu'il soit possible de remplacer sa batterie très facilement et rapidement sans aucun outils.
Ce pack batterie Lithium Polymère (LiPO) d'une capacité de 1400mAh et d'une tension nominale de 7.4V est doté d'une mémoire EEPROM permettant de lire la tension réelle de la batterie, la capacité restante ainsi que les courants instantané et moyen débités par la batterie.