La planche de contrôle des robots Kilobot utilisée en conjonction avec le logiciel Kilobot controller permet de gérer une grande quantité de robots Kilobot en même temps. Cette planche est très utile pour la robotique en essaim.
Placé à 1m au dessus de la zone d'évolution de l'essaim robotique, il peut communiquer avec les robots Kilobots via l’émission de lumière infrarouge permettant ainsi à l'utilisateur de :
- Envoyer un nouveau programme à tous les Kilobots en même temps
- Contrôler les robots Kilobots pour par exemples les allumer ou les éteindre tous en même temps
Ces actions peuvent être réalisées pour chaque Kilobot dans une zone de 1 m de diamètre située sous la planche de contrôle comme présenté dans le schéma ci-dessous.

Le logiciel Kilobot controller peut programmer un robot Kilobot individuel en utilisant le programmateur ISP embarqué. Il peut également se connecter au port série d'un robot Kilobot spécifique afin d'afficher ses caractéristiques à l'écran d'un PC.